编码器属精密元件，这主要因为编码器周围干扰比较严重，比如，是否有大型电动机、电焊机频繁起动造成干扰，是否和动力线同一管道传输等。选择什么样的输出对抗干扰也很重要，一般输出带反向信号的抗干扰要好一些，即a+~a-b+~b-z+~z-，其特征是加上电源8根线，而不是5根线（共零）。带反向信号的在电缆中的传输是对称的，受干扰小，在接受设备中也可以再增加判断，例如接受设备的信号利用a、b信号90°相位差，读到电平10、11、01、00四种状态时，计为一有效脉冲，此方案可有效提高系统抗干扰性能，计数准确。编码器生产厂家介绍三种简单的初步判断方法：

1、排除（搬离、关闭、隔离）干扰源

2、判断是否为机械间隙累计误差

3、判断是否为控制系统和编码器的电路接、不匹配、编码器选型错误
 
   以上三点方法试验过后故障现象排除，则可初步判断，若未排除须进一步分析。判断是否为编码器自身故障的简单方法是排除法。排除法的具体方法是用一台相同型号的编码器替换上去，如果故障现象相同，可基本排除是编码器故障问题，因为两台编码器同时有故障的小概率事件发生可能很小，可以看作为0。假如换一台相同型号编码器上去，故障现象立刻排除，则可基本判定是编码器故障。